【摘 要】
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为考察山羊多羔性的遗传基础,用同一品种不同繁殖力山羊发情期卵巢组织差异表达PCR方法筛查到4条基凶差异显示片段作为山羊繁殖力性状候选基因,对这些候选基凶进行同源性和转录
【机 构】
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河北农业大学动物科技学院,保定 071001
【出 处】
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中国畜牧兽医学会信息技术分会2011年学术研讨会
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为考察山羊多羔性的遗传基础,用同一品种不同繁殖力山羊发情期卵巢组织差异表达PCR方法筛查到4条基凶差异显示片段作为山羊繁殖力性状候选基因,对这些候选基凶进行同源性和转录因子结合位点分析,发现4个差异片段中两条为新发现的表达片段。1条与野猪中获得的克隆片段THY010003E05同源性为81%,但功能未知。另1条差异片段的序列与牛PCNP的mRNA序列的同源性为94%,并据此对山羊PCNP基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学的相关软件和方法,对山羊PCNP蛋白的理化性质、二级结构、信号肽、核定位序列、磷酸化位点、跨膜区域以及蛋白质功能域等进行了预测,PCNP蛋白是一种定位于细胞核中的亲水蛋白,二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主,局部为延伸链和β转角:预测出与PCNP蛋白相互作用的5种蛋白,另外还发现了3个LCR(low complexity region)区域。
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