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串联质谱法被认为是最有力的蛋白测序分析手段[1]。在能量的作用下,肽段主链的断裂产生系列b,y,a离子等,通过比较同系列离子的质量差,测序软件可得到肽中氨基酸组成信息。测序准确性的提高源于人们对碎裂机理的不断认识,其中,一些氨基酸产生特异性中性丢失[2,3],对这些中性丢失产物的确认会提供额外的测序信息。