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专利报道了一种双液相萃取处理菜籽、棉籽的方法，该方法可以得到脱除了硫甙、棉酚等有毒物质的饼粕，同时由于在常温下操作，蛋白质没有受到伤害，营养价值没有下降。另一方面，由于极性相溶解了色素、胶质、游离脂肪酸以及部分水等杂质，实际上起到了对油进行洗涤、提纯的作用，所得毛油的质量远远优于传统工艺生产的毛油，多项指标已经与精制油相当。本文借鉴这种双液相萃取方法对棉籽进行处理，在得到脱毒棉粕的同时，以含有高质量毛油的非极性相直接或回收部分非极性溶剂后用于酯交换反应，得到脂肪酸甲酯和甘油。通过这种方法，试图降低脂肪酸甲酯的生产成本，并且降低洗涤废水排放量。