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本文针对MODFLOW处理混合开采井流量在各含水层分配上存在的问题，提出了流量权重迭代计算方法。该方法不仅考虑各含水层渗透性差异，而且考虑了抽水井周围水头差对含水层流量的贡献。以三维非稳定流理想模型为例，通过对各单元网格的水头和抽水井所处各层流量权重的双重迭代求解，得出非均质含水层中各层井流量的分配量。在此基础上，进一步分析不同网格剖分对混合机井各层流量计算的影响及其井水位的校正方法。