【摘 要】
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柞蚕很容易感染柞蚕核多角体病毒(Antheraea pernyi nucleopolyhedroviruses,AnpeNPVs)而产生一种名为柞蚕脓病的疾病,是柞蚕的主要病害之一.本研究中,我们测序并分析了
【机 构】
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重庆师范大学生命科学院,重庆40047
【出 处】
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重庆市昆虫学会2013年学术交流及研讨会
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柞蚕很容易感染柞蚕核多角体病毒(Antheraea pernyi nucleopolyhedroviruses,AnpeNPVs)而产生一种名为柞蚕脓病的疾病,是柞蚕的主要病害之一.本研究中,我们测序并分析了一株从中国河南省分离的柞蚕NPV (AnpeNPV-H).AnpeNPV-H的全基因组大小和GC含量分别为125,605 bp and 53.4％.我们共预测了142个开放阅读框(ORF),每个ORF至少为50个氨基酸,占全基因组的91.08％.同时,我们预测出的功能基因中包括36个在大多数NPV中被认为的核心基因,暗示着这些基因在进化过程中的保守性.通过三株柞蚕NPV的全基因组来鉴定他们间的单核苷酸多态性(SNP).AnpeNPV-H和AnpeNPV-Z之间有204个SNPs,落在基因间区和基因区的分别有19和185个；AnpeNPV-H和AnpeMNPV-L之间有211个SNPs,落在基因间区和基因区的分别有28和183个.基于SNP数据和蛋白序列的进化分析表明AnpeNPV-L和AnpeNPV-Z有更近的情缘关系,这样也符合他们间的地理亲和性.在比较中我们发现由于遗传重组的发生导致共线性可能不是一个可靠的系统发育重建信号.尽管基因复制会影响AnpeNPVs的进化,但它不是基因组进化的主导因素.适应性进化分析表明有三个编码蛋白基因受到正选择的作用,包括odvodv-e56,P94-like,和egt.我们的研究不仅对AnpeNPVs基因组结构和进化的演化提供了一个借鉴,也有助于揭示AnpeNPVs致病能力的基因成分.
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