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为了从分子水平分析病毒与宿主之间的相互作用，应用差异蛋白质组学方法对IBDV感染鸡后法氏囊组织蛋白的动态表达变化进行了研究分析。二维凝胶的差异表达分析显示，鸡感染IBDV后，法氏囊组织共有96个蛋白点出现了显著的差异表达。采用MALDI-TOF／TOF质谱法对差异表达蛋白点进行质谱鉴定，结果成功鉴定了65个表达差异显著的蛋白点，对应54种蛋白，包括12种表达上调蛋白和42种表达下调的蛋白。对鉴定蛋白的功能分析表明，这些差异蛋白主要涉及细胞骨架网络、应激反应、大分子合成、能量代谢、泛素-蛋白酶体通路、信号传导通路及一些功能未知的蛋白的变化，这些差异蛋白可能通过不同途径参与了IBDV感染机体的过程并发挥着不同的功能。这些差异蛋白的鉴定为进一步揭示IBDV致病的分子机制提供了丰富的实验数据和有用线索，对发现和开发潜在的生物标记分子提供了重要参考。