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三峡大坝建成蓄水后，明显改变了长江流域的水文条件，但有关长江全干流的浮游植物种类和丰度的影响未见报道。2004年3月～2005年5月，共5次调查从涪陵到江阴共29个站点，发现107个浮游植物分类单元，优势种类为硅藻，其次绿藻和蓝藻；浮游植物丰度变化较大，31.3万～383万cells/L；干流的氮、磷、硅的浓度与浮游植物没有明显的相关性，而与干流的流量呈显著的负相关(Spearman r=-1.00，p＜0.01)，表明长江干流浮游植物种类和丰度主要受水文情势而非营养盐浓度决定，为改善长江流域生态环境提供科学依据。