【摘 要】
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目的:检测嗜酸性鼻息肉组织中串联可选择性多聚腺苷酸化位点的使用情况.方法:2例嗜酸性鼻息肉患者,取息肉组织及临近正常黏膜组织,提取总RNA,构建转录组测序文库,用二代测序技术研究鼻息肉组织转录组3末端核苷酸序列.用生物信息学方法分析多聚腺苷酸化位点的使用情况.以实时荧光定量PCR验证测序结果.结果:相对于钩突黏膜组织来说,息肉组织存在3非编码区长度多态性.105个基因在鼻息肉组织中倾向于使用远端的
【机 构】
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中山大学孙逸仙纪念医院耳鼻咽喉头颈外科 中山大学生命科学院生物化学系,生物控制与利用重点实验室
【出 处】
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2014第四届全国耳鼻咽喉科医师大会
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目的:检测嗜酸性鼻息肉组织中串联可选择性多聚腺苷酸化位点的使用情况.方法:2例嗜酸性鼻息肉患者,取息肉组织及临近正常黏膜组织,提取总RNA,构建转录组测序文库,用二代测序技术研究鼻息肉组织转录组3末端核苷酸序列.用生物信息学方法分析多聚腺苷酸化位点的使用情况.以实时荧光定量PCR验证测序结果.结果:相对于钩突黏膜组织来说,息肉组织存在3非编码区长度多态性.105个基因在鼻息肉组织中倾向于使用远端的可选择性多聚腺苷酸化位点;90个基因倾向于使用近端的可选择性多聚腺苷酸化位点.基因富集分析表明,3非编码区长度变化的基因主要富集在转录调节,凋亡,代谢等细胞通路.其次,我们的基因表达分析结果表明,息肉组织与钩突黏膜存在差异基因表达,在两者之间627个基因存在明显的差异表达.定量PCR结果与我们的测序结果一致.结论:可选择性多聚腺苷酸化位点介导的3非编码区长度多态性调节在息肉组织中存在,其可能在息肉发病及炎症持续中发挥重要作用.
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