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毛细管电泳(CE)是近年来迅速发展起来的一种新型生物大分子分离分析技术，本文细致考察无胶筛分毛细管电泳(NGS-CE)分离标准蛋白Pmtein Molecular Weiht Marker(Broad)D532S的实验条件，并进行适当改进。结果表明实验室常用缓冲液TBE可作为GE分离蛋白质的缓冲液，并且将筛分介质的填充作为一个单独的过程是完全可行的，且效果较好。建立的方法与常规SDS-PAGE相比在时间、检测限等方而具有明显的优势。实验中发现毛细管柱经修饰之后与空柱相比其EOF稳定，尤其是在中性范围内，结合pH值较稳定的荧光试剂，对于中性蛋白质以及活性蛋白质的分析具有潜在的应用价值。