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琼胶是一种重要的海藻多糖，由琼脂糖与硫琼胶两种成分组成的混合物，在食品工业、医药工业、日用化工、生物工程等许多方面有广泛的应用，是目前世界上用途最广泛的三大海藻胶之一。琼胶酶可以降解琼脂糖，得到琼胶寡糖。目前已有不少研究表明琼胶寡糖具有多种生理活性，如保湿、增白，可望作为化妆品添加剂，还具有益生元效应、抗氧化作用、抗病毒、抗炎和肿瘤抑制等活性。琼胶酶可帮助实现从琼胶到具有多种生理活性的琼胶寡糖的转化。