RHDV CD株VP60主要抗原表位基因的克隆与序列分析

来源 :辽宁省畜牧兽医学会2014年学会年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ll730520
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本实验用RHDV CD株人工感染家兔,发病死亡后,取肝脏匀浆,用Trizol试剂从匀浆上清中提取病毒RNA.根据Genbank已发表序列保守区设计并合成引物,采用RT-PCR方法扩增了RHDV衣壳蛋白VP60主要抗原表位基因.PCR产物纯化后,进行序列测定.测序结果表明,VP60主要抗原表位基因长525bp.该序列与已发表的其它13株RHDV VP60同一核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行同源性比较.结果显示,C)株核酸序列与WX-84株同源性最高为97.5%,与其它毒株的同源性在92.0%-96.6%之间.氨基酸序列与WX-84株、墨西哥Mexico-89株同源性最高为99.4%,与其它毒株的同源性在96.6%-98.3%之间.
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