泥蚶Smad1基因cDNA全长和内含子克隆及组织表达差异性分析

来源 :2013年全国海水养殖学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zou123456ting
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Smads蛋白家族是迄今为止唯一被证实的转化生长因子-p(TGF-田信号的细胞质内介导者。本研究基于己构建的泥蚶转录组文库,用RACE技术克隆得到了泥蚶Smad1基因的cDNA序列,序列分析表明,泥蚶Smadl与太平洋牡蛎同源性最高,与其他物种的同源性均在70%以上。基因组序列分析表明,泥蚶Smadl基因由4个外显子和3个内含子组成,与太平洋牡蛎内含子数目相同,其中4个外显子分别长604bp、351bp、222bp、1265bp,内含子长504bp、555bp、631bp。泥蚶Smadl基因的3个内含子都起始于GT,终止于AG,符合内含子共同剪接位点序列。利用荧光定量qRT-PCR技术,对泥蚶外套膜、鳃、血液、斧足、闭壳肌、内脏6个组织中Smadl基因的表达特异性进行了分析,结果发现,Smadl在6个组织中均有表达,而在斧足和闭壳肌两个横纹肌丰富的组织中表达量最高,初步推测Smadl基因对泥蚶肌肉组织的生长有重要作用。本研究为泥蚶Smadl基因的功能分析、SNP位点分离及其与生长性状的关联分析奠定了重要基础。
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