【摘 要】
:
分支酸在大多数生物体(除了动物)的新陈代谢中都有重要的作用,它是初级和次级代谢之间的中央分支点,常常被用于苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸的合成。此外,分支酸和其衍生物
【机 构】
:
吉林大学理论化学研究所,吉林省长春市,130023
论文部分内容阅读
分支酸在大多数生物体(除了动物)的新陈代谢中都有重要的作用,它是初级和次级代谢之间的中央分支点,常常被用于苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸的合成。此外,分支酸和其衍生物的分解产物也可以被用于药物的制备如铁载体、聚酮和萜类药物。其中,分支酸酶催化分支酸生成丙酮酸盐和安息香酸盐。这些产物因其具有手型中心和多个功能团,通常被作为多种药物的合成起点。分支酸酶[1-2]包含三个子族分别为:CH-FkbO,CH-Hyg5,CH-XanB2,如下图所示。至今为止,分支酸酶的催化机理仍然是不清楚的。为此,我们利用QM/MM方法研究了FkbO和Hyg5酶的催化反应。我们的研究,从分子和原子水平上表征了整个反应机制,计算得到了酶催化的反应能垒确定了决速步骤;此外我们还获得了整个反应过程中过渡态和中间体的结构信息。这些结果对于进一步理解分支酸酶的催化机制以及新型催化剂的改造都有着重要的意义。
其他文献
HPPK是一种重要的激酶和潜在的抗生素靶点,其作用是催化细菌体内重要生命物质叶酸合成的第一步反应。在HPPK的催化过程中,HPPK先结合MgATP,再结合HP,然后催化反应才能发
通过研究金(I)催化环化吲哚反应[1]的机理,探索配阴离子对质子转移的影响。计算结果表明配阴离子Cl-,OTf-和BF4-作为质子shuttle可以大大降低质子转移过程中的能垒。更为
在这篇论文中,我们应用从头算电子结构计算和非绝热动力学模拟方法研究了气相反式丙烯醛和2-环戊烯酮的光诱导内转换和系间窜越过程.计算结果表明,从Franck-Condon区到第
生物钟蛋白CLOCK和BMAL1可以聚合,然后识别并绑定特定的E-box DNA来调节其它生物钟蛋白的转录和翻译过程,因此CLOCK和BMAL1蛋白的聚合以及与DNA的识别在整个昼夜节律调节
噻替哌和替哌是临床上广泛使用的广谱抗肿瘤药物[1-2],其分子结构见Fig.1.在CAM-B3LYP/6-311++G(d,p)理论水平上优化了[Thiotepa(Tepa)-nH2O](n=1,4)反应过程中反应物、
以多层聚电解质为衬底,通过囊泡(可以连接功能性蛋白)吸附、扩散制备的磷脂双层在模拟细胞膜方面有很大的优势,但是囊泡是如何破裂形成磷脂双层的不是很清楚。在这篇文章
我们根据物质的扩散系数的定义[1,2],提出了一个新的分子动力学参数--原子的扩散系数(Datom).通过分析分子动力学轨迹文件中每个原子的均方位移,可以推导计算出Datom.在
自组装是自然界中广泛存在的一种现象,也是当今科学研究的前沿问题。由多肽自组装而成的淀粉状纤维,由于β-折叠片的紧密堆积而形成规整的结构,往往被用作功能化的基底。我