【摘 要】
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目的：研究加系SPF大白、长白猪SLA-1基因的多态性.
方法:采取15头大白猪和22头长白猪血液,分离外周血淋巴细胞,提取总RNA,反转录cDNA,设计特异性引物进行RT-PCR扩增测序,
【机 构】
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牡丹江师范学院生命科学与技术学院,牡丹江157011;甘肃农业大学动物科学技术学院,兰州730070中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,哈尔滨150069牡丹江师范学院生命科学与
【出 处】
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2016第十四届中国北方实验动物科技年会
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目的：研究加系SPF大白、长白猪SLA-1基因的多态性.
方法:采取15头大白猪和22头长白猪血液,分离外周血淋巴细胞,提取总RNA,反转录cDNA,设计特异性引物进行RT-PCR扩增测序,获得等位基因序列进行多态性分析.
结果:成功获得16个SLA-1等位基因,其中4个为新等位基因,由ISAG SLA命名委员会命名为SLA-1*0703、SLA-1*0704、SLA-1*0811、SLA-1*0812.在全长1086bp的完整开放阅读框(ORF),核苷酸多样度(Pi)为0.04559,单倍型多样度(Hd)为0.00049,平均核苷酸差异数(K)为49.508,150个核苷酸变异位点中简约信息位点远高于单一多态位点;共编码361个氨基酸产生183个突变,非同义突变远高于同义突变.胞外区a1、a2存在33个关键氨基酸,其中9个为保守氨基酸,其余24个均发生高频率突变,它们共同构成了6个抗原肽结合槽口袋(A-F).
结论:本研究成功鉴定了16个SLA-1等位基因,具有高度的多态性,且高变区集中于第2、3外显子,对SPF大白、长白猪构建动物模型具有至关重要的作用.
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