南极菲尔德斯半岛细菌群落结构分析

来源 :2013中国极地科学学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ryan1114
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  为了解南极菲尔德斯半岛的微生物群落结构,本文采用培养和DGGE两种方法对南极的湖泊沉积物、海洋沉积物、企鹅粪土和土壤中的细菌群落结构进行了分析。对培养分离到的70株菌株的16S rDNA序列进行了鉴定,主要分为放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、γ-变形菌门和β-变形菌门5个类群;采用DGGE方法鉴定到的细菌种类较可培养方法分离的细菌种类丰富,主要包括α-变形菌门、β-变形菌门、γ-变形菌门、δ-变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、绿菌门和异常球菌-栖热菌门。在两种方法的结果中,γ-变形菌门均为该地区的优势菌群。通过对DGGE结果的聚类分析表明,土壤和湖泊样品中的细菌群落结构较为相近,企鹅粪土与海洋沉积物的细菌群落结构较为相近。通过比较可培养方法和DGGE方法鉴定序列比对结果可以看出,培养分离的菌株多数与分离自冷环境的序列相近,而DGGE方法鉴定的序列则较少的与冷环境的序列相近,说明了由于传统的可培养方法采用,对南极的可培养的细菌鉴定的较多,而对一些不可培养的细菌的了解还较少。
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