【摘 要】
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目的:探讨艾叶作为灸材的转录组学物质基础.方法:采摘新鲜艾草后分别提取叶、根、茎组织的总RNA并建立三个组织的cDNA文库,进行高通量测序.对测序后的原始读段进行过滤得到clean reads,使用Trinity软件对clean reads进行de novo组装得到功能基因,再对功能基因进行KEGG注释和表达量的计算.结果:艾草高通量测序获得99,807个功能基因,与KEGG数据库比对后得到萜类和
【机 构】
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安徽中医药大学研究生院,安徽合肥230012 安徽中医药大学新安医学教育部重点实验室,安徽合肥23
【出 处】
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第三届庐州灸法论坛、灸法应用与机理研究学术研讨会暨安徽省灸法研究会2017年学术年会
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目的:探讨艾叶作为灸材的转录组学物质基础.
方法:采摘新鲜艾草后分别提取叶、根、茎组织的总RNA并建立三个组织的cDNA文库,进行高通量测序.对测序后的原始读段进行过滤得到clean reads,使用Trinity软件对clean reads进行de novo组装得到功能基因,再对功能基因进行KEGG注释和表达量的计算.
结果:艾草高通量测序获得99,807个功能基因,与KEGG数据库比对后得到萜类和纤维素合成的代谢通路,发现参与萜类物质合成的相关基因有116个,编码16种关键酶;参与纤维素合成相关基因有21个,编码2种关键酶.在萜类物质合成的关键酶基因中,叶、根、茎组织中都仅存在1个MVD基因和2个CMS基因,并且这三种关键酶基因均在叶中的表达水平最高.
结论:艾草中存在许多参与萜类和纤维素合成的关键酶基因,但其最关键的限速酶在艾叶中的表达量比根、茎高,提供了艾叶作为灸材的转录组学物质基础,这可能是艾叶作为灸材的关键因素之一.
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