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作为科学使用海域的基础性工作之一，海域使用论证不仅为海域管理提供了科学依据，也为海洋资源可持续利用提供了一定的保障。本文以国内外相关研究成果为基础，通过实例探讨研究增养殖和旅游两类常见用海的海域使用论证中自然环境条件适宜性分析指标选取思路。在进行海域使用论证自然条件适宜性分析时，应依据海洋功能区划，遵循充分发挥自然条件的优势和资源可持续利用的原则，因地制宜、客观合理地选取分析指标，通过综合的分析方法，以获得符合实际的结论，为海洋资源可持续利用提供科学依据。