【摘 要】
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目的:应用全基因组测序技术追踪耐多药结核病的传播关系.方法:收集2008-2012年间某结核病定点医院与另一结核病定点医院患者菌株基因分型序列检测具有高度同源性的9例患者的菌株,对这9例患者开展现场流行病学调查、药敏试验、可变数目串联重复序列(VNTR)分型及全基因组测序等相关实验室检测.结果:9例患者均是MDR-TB患者.VNTR分型法结果显示,9例患者具有相同的VNTR基因型,是成簇菌株,相互
【机 构】
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200336 上海市疾病预防控制中心结核病和艾滋病防治所 闵行区疾病预防控制中心结核病防治科
【出 处】
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中国防痨协会2016年全国学术大会
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目的:应用全基因组测序技术追踪耐多药结核病的传播关系.
方法:收集2008-2012年间某结核病定点医院与另一结核病定点医院患者菌株基因分型序列检测具有高度同源性的9例患者的菌株,对这9例患者开展现场流行病学调查、药敏试验、可变数目串联重复序列(VNTR)分型及全基因组测序等相关实验室检测.
结果:9例患者均是MDR-TB患者.VNTR分型法结果显示,9例患者具有相同的VNTR基因型,是成簇菌株,相互之间存在近期传播关系.进行全基因组测序,其结果表明:9例VNTR簇患者被分成了两种传播关系网络,其中5例甲结核病定点医院患者和2例乙结核病定点医院患者在其中一个大簇,任一菌株与同簇其他菌株的最近遗传距离小于7个单核苷酸多态性(SNP),并且具有相同的耐药突变,表明相互之间为近期传播关系;另外2例患者形成了另一个小簇,其簇相差大于25个SNP,表明此2例患者和上述7例患者遗传距离相隔较远,可能并不存在直接传播关系.
结论:基于全基因组测序数据研究耐药结核病的传播网络,能准确鉴别传播途径和方向,识别传染源和传播缺失环节.
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