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合并单元作为电子式互感器与二次设备连接的重要组成部分，受到越来越多研究人员的关注。在实际使用中，为减小采样的时间误差，不仅变电站的各合并单元之间需要同步，合并单元内各A/D转换器之间也同样需要同步。本文提出了基于IEEE1588精密时间协议的合并单元间同步的实现方法，以及利用锁相环技术实现合并单元内同步的方法，硬件设计采用DP83640芯片，将时间协议功能设于物理层。该方法同步精度高，运行可靠，适用于实际应用。