【摘 要】
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通过对分子动力学并行算法的研究,本文在IBM RS/6000工作站机群和PVM环境中,消息传递机制方式实现了微正则系综(NVE)分子动力学的并行计算程序.通过对不同分子数(分子数从256～108000)组成的氩气系统模拟,认为在考虑分子间长程作用力时,采用原子分解法实现分子动力学并行算法具有理想的加速比,在只考虑分子间短程作用时,采用空间分解法算法则具有理想的加速比.
【机 构】
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西安交通大学能源与动力工程学院(西安) 西安交通大学新型计算机研究所(西安)
【出 处】
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中国工程热物理学会工程热力学与能源利用学术会议
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通过对分子动力学并行算法的研究,本文在IBM RS/6000工作站机群和PVM环境中,消息传递机制方式实现了微正则系综(NVE)分子动力学的并行计算程序.通过对不同分子数(分子数从256～108000)组成的氩气系统模拟,认为在考虑分子间长程作用力时,采用原子分解法实现分子动力学并行算法具有理想的加速比,在只考虑分子间短程作用时,采用空间分解法算法则具有理想的加速比.
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