衣原体噬菌体phiCPG1衣壳蛋白Vpl二级结构及B细胞抗原表位预测

来源 :2014全国中西医结合皮肤性病学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qq77880066
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  目的:分析衣原体噬菌体phiCPG1 Vpl蛋白的二级结构并预测其B细胞表位。方法:以该蛋白氨基酸序列为依据,同时采用三种不同方法:Gamier Robson法、Chou-Fasman法及Karplus-Schulz法行二级结构分析预测;并采用Kyte-Doolittle法、Hopp-Woods法、Emini法和Jameson-Wolf法分析推断可能的B细胞表位。结果:该蛋白存在多样化的二级结构,多方法分析后其氨基酸序列N端第1-10,103-110,158-166, 190-196,252-259,273-284,309-315,414-422,470-476为优势表位。结论:phiCPG1 Vpl蛋白二级结构复杂,并有多达9个强B细胞表位,有较强免疫原性。
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