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通过2011年1-12月对太湖(五里湖)蓝藻水华的调查和研究,蓝藻水华种类主要有微囊藻属Microcystis种类、鱼腥藻属Anabaena、束丝藻属Aphanizomenon、颤藻属Oscillatoria、浮丝藻属Planktothrix和尖头藻属Raphidiopsis等6属18种.太湖主要为微囊藻水华,五里湖主要为丝状蓝藻水华.微囊藻属的演替规律基本为春(水华微囊藻M.flos-aquae、鱼害微囊藻M.ichthyoblabe)→夏(鱼害微囊藻M.ichthyoblabe、惠氏微囊藻M.wesenbergii)→秋(铜绿微囊藻M.aeruginosa、惠氏微囊藻M.wesenbergii)→冬季(水华微囊藻M.flos-aquae、片状微囊藻M.panniformis).