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在水生生态系统中，沉积物是营养物、重金属、持久性有机污染物(POPs)的汇和源。在外源得到有效控制的情况一下，生物或物理因子等作用促使的沉积物释放，仍有可能导致水体在相当长的时期内维持富营养化或水质恶化等不良状态。
目前污染沉积物的治理方法有原位修复和异位处置。生物修复技术是既可用于原位修复又可用于异位处置的一种方法，具有投资少、见效快且没有二次污染的优点，是一种具有广阔应用前景的技术。