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目的：了解广东省HIV/HCV共感染患者与单纯HCV感染者的感染途径、HCV的基因亚型分布及遗传特征，为丙型肝炎病毒的治疗与预防提供依据。
方法采用巢式RT-PCR扩增广东省95例HIV/HCV共感染患者及99例单纯HCV感染者HCVNS5B基因区域，PCR产物测序后进行HCV基因亚型分析，遗传分析利用MEGA4软件。结果 HIV/HCV共感染患者主要通过静脉注射毒品(79％)感染，HCV有5种基因亚型，不同基因亚型及比例分别为6a(53.7％)、3a(17.9％)、1b(15.8％)、3b(11.6％)和1a型(1％)，亚型内基因距离1b高于其它基因亚型，通过静脉注射毒品感染的HIV/HCV共感染患者HCV基因亚型主要为6a，占60％；单纯HCV感染者主要通过输血或血液制品(81％)感染，HCV有7种基因亚型，不同基因亚型及比例分别为1b(67.7％)、6a(17.2％)、3a(6.1％)、2a(5％)、3b(2％)、4a(1％)和5a(1％)型，亚型内基因距离1b高于其它基因亚型，通过输血或血液制品感染的单纯HCV感染者HCV基因亚型主要为1b，占76.2％。
结论广东地区HIV/HCV共感染患者及单纯HCV感染者HCV基因亚型呈现多样性，HIV/HCV共感染患者与单纯HCV感染者主要感染途径不同，HCV主要基因亚型也不同。