猪源新城疫病毒SP13株的F基因克隆及序列分析

• 作 者: 郑腾[1]程龙飞[2]李志方[3]柯美峰[4]黄瑜[2]李文杨[2]施少华[2]
• 机 构: 福建出入境检验检疫局 福州 350003
• 出 处: 第二届全国人畜共患病学术研讨会
• 发表日期: 2008年期

本研究采用RT-PCR方法对猪源新城疫病毒(NDV)SP13株的F基因进行了扩增与克隆，并测定出F基因的核苷酸全序列，推导出氨基酸序列。F基因全长为1662bp,单一的开放阅读框，编码553个氨基酸的长肽，裂解位点的氨基酸序列为112G－R－Q－G－R－LL117，与弱毒株在这一区域的序列(112G－R/K－Q－G/S－R－L117)相符，F蛋白有6个潜在的糖基化位点和13个Cys残基位点，其疏水构型有3个强疏水区。通过同源率、系统发育、致病性、疏水性和抗原性等比较分析。结果表明SP13与LaSota、Clone 30不但同源性达到99.9％，而且在致病性、疏水性和抗原性等方面也极为相似。