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多载波调制可以在联合信源信道编码中提供不同的误码保护。如果根据不同数据的重要性来调节每个子信道的能量、调制方法和信道编码方法，总的传输误差可以达到最小。为了获得更好的性能，现有信源编码器的输出可以进行能量再分配，另外，信源编码器和多载波调制器也可以进行迭代优化。与单载波传输比较，多载波传输的性能有了明显的改善。