【摘 要】
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目的:克隆秦川牛增强子结合蛋白(C/EBP)基因的CDS序列,并进行组织表达谱和蛋白质结构分析,为肉牛的分子育种提供理论基础.方法:以比较基因组学为基础,采用RT-PCR和PCR方法获得了C/EBP基因的CDS序列;并采用Real-time PCR方法分析C/EBP基因在秦川牛15个组织中的表达;通过生物信息学方法预测了牛C/EBP基因的蛋白结构.结果:秦川牛C/EBP基因的CDS全长1062bp
【机 构】
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西北农林科技大学,动物科技学院,中国,陕西杨凌,712100 西北农林科技大学,动物科技学院,中国
【出 处】
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2011中国肉牛选育改良与产业发展国际研讨会
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目的:克隆秦川牛增强子结合蛋白(C/EBP)基因的CDS序列,并进行组织表达谱和蛋白质结构分析,为肉牛的分子育种提供理论基础.方法:以比较基因组学为基础,采用RT-PCR和PCR方法获得了C/EBP基因的CDS序列;并采用Real-time PCR方法分析C/EBP基因在秦川牛15个组织中的表达;通过生物信息学方法预测了牛C/EBP基因的蛋白结构.结果:秦川牛C/EBP基因的CDS全长1062bp(e)在所检测的15个组织中,C/EBP基因mRNA均有表达,在脂肪组织中的表达明显高于其它组织.C/EBP无明显的信号肽,在第233~252氨基酸区域有明显的跨膜区域.蛋自二级结构主要由螺旋、无规则卷曲和少量直链延伸组成.结论:本研究成功克隆秦川牛(C/EBP)基因完整的CDS区域;获知在第277~340位的螺旋组成了亮氨酸拉链(bZIP)结构.秦川牛C/EBP基因编码的氨基酸序列与野猪、人、褐家鼠、兔、小家鼠的氨基酸序列同源性分别为97%,95%,94%,94%,93%,表明在进化关系上,C/EBP氨基酸序列具有很好的保守性.
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