【摘 要】
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目的 应用基因表达谱芯片对糖尿病大鼠创面与正常大鼠创面基因表达谱进行对比分析并筛选差异基因,探讨其特征及可能的生物学意义,为治疗糖尿病创面提供新途径和线索.方法
【机 构】
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330006 南昌大学第一附属医院烧伤研究所,江西省创面修复工程技术研究中心
【出 处】
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2014感染伤口的防治与修复研讨会、中国金属学会冶金安全与健康分会烧伤外
科学专业委员会年会、华北地区烧伤与整形外科学术
论文部分内容阅读
目的 应用基因表达谱芯片对糖尿病大鼠创面与正常大鼠创面基因表达谱进行对比分析并筛选差异基因,探讨其特征及可能的生物学意义,为治疗糖尿病创面提供新途径和线索.方法:将饲养的SD雄性大鼠,随机分为DM组和正常对照组.DM组大鼠采用一次性腹腔注射链脲佐菌(Streptozocin, STZ,65 mg/kg)制备DM大鼠模型.给药3周后随机抽取稳定成模的糖尿病大鼠和正常大鼠,在背部制成直径2.0 cm的圆形全层皮肤缺损创面.72小时后分别取糖尿病创面大鼠和正常大鼠创面大鼠,在圆形全层皮肤缺损创面上取创面组织.TrizoI—步法分别提取各组组织总RNA,琼脂糖甲醛变性凝胶电泳质检.通过逆转录法将cy3荧光标记到糖尿病大鼠创面组与正常大鼠创面组的cDNA上,制备探针并与表达谱芯片进行杂交,用Agilent G2565CA Microarray Scanner进行扫描,得到杂交图片.采用Feature Extraction(v10.7)软件对杂交图片进行分析并提取数据,然后用博奥表达谱芯片Analyzer软件进行分析,把图像信号转化为数字信号,以2倍差异表达值筛选差异表达基因.选择明显上调或下调的基因,用实时RT—PcR技术进一步验证相关基因.结果:与正常大鼠创面组比较,糖尿病大鼠组差异表达基因2206个,其中上调的基因785个、下调的基因1421个,根据基因功能分类发现差异基因涉及糖代谢、蛋白质合成、离子通道、神经传导等多个生物学过程,实时RT—PCR验证结果与芯片筛选结果一致.结论:糖尿病大鼠皮肤创面与正常大鼠皮肤创面基因表达谱有明显不同,其差异可能与糖尿病大鼠皮肤创面与正常大鼠皮肤创面修复能力不同密切相关.
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