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利用分子微生物生态学技术可以摆脱传统微生物分离培养鉴定方法培养过程复杂、研究周期较长、不能满足微生物原位识别等缺陷,极大地推进了环境污染研究进展.本文综述了应用于环境污染研究中的各项分子微生物生态学技术,包括PCR技术、变性凝胶电泳(DGGE)检测技术、核酸分子杂交技术、基因芯片技术以及实时荧光定量PCR技术等,并介绍了分子微生物生态学技术在污染环境的监测、微生物多样性的研究、种群结构和动力学的研究、污染物迁移转化分子机制研究以及对环境污染物的科学的危险性评价等方面的应用.