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对青海全省分布的冬虫夏草寄主幼虫、人工培养得到的幼虫、天然虫草的肠道菌群进行分离、培养并进行对比分析试验的结果表明:在所有的肠道中以葡萄球菌属的数量较大,分离频率较高,为优势菌群;在人工培养的幼虫肠道内没有检出真菌,可能与饲养环境无菌的情况有关;放线菌仅存在于自然采挖的幼虫肠道内,在冬虫夏草和人工饲养的寄主幼虫的肠道内无未检出,说明在野外的生存环境条件下由于寄主幼虫取食的多样性和杂食性,以及土壤区系微生物的作用,造成自然条件下寄主幼虫肠道内菌群较人工饲养的寄主幼虫的肠道菌群复杂;通过对不同季节寄主幼虫肠道菌群的分离试验,发现只有在8～11月份的寄主幼虫肠道内能够分离出与冬虫夏草相似的真菌;添加优势菌群对于人工无菌饲养的寄主幼虫没有根本性的伤害;肠道真菌的存在对于冬虫夏草的形成具有关键的作用,该真菌的生物学地位、培养的最佳条件及与冬虫夏草的关系是今后研究的重点方向.