【摘 要】
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脊尾白虾是我国重要的经济养殖种类,具有生殖周期短,可实现在实验室全年养殖等特点,被认为是开展虾类发育和免疫研究的较好的动物模型,但目前仍缺少对其分子遗传学基础方
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脊尾白虾是我国重要的经济养殖种类,具有生殖周期短,可实现在实验室全年养殖等特点,被认为是开展虾类发育和免疫研究的较好的动物模型,但目前仍缺少对其分子遗传学基础方面的研究。为对脊尾白虾遗传学的分子基础进行深入了解,本实验利用新一代测序技术(ROCHE454)对脊尾白虾胚胎发育不同时期以及成虾应对各种病原刺激的转录组进行了测序、拼接和注释,并对胚胎的基因表达与成虾进行了比较,以挖掘与胚胎发育或免疫相关的功能基因。结果显示,两个转录组共拼接得到47574条Unigenes,注释率为38%。通过比较,得到成虾组特有ESTs 9332个,胚胎组特有ESTs 7557个;通过基因家族和结构域的预测,发现成虾组含有更多的锌指结构域(Zinc finger domain)、Major facilitator Superfamily domain、C型凝集素(C-type lectin)结构域、几丁质结合结构域(Chitin binding domain)、细胞色素450 (Cytochrome P450)结构域,说明了成虾在应对各种病原刺激时免疫相关基因的表达增加;胚胎组特异表达的基因中鉴定到了更多的昆虫表皮蛋白(Insect cuticle protein)基因,说明在胚胎阶段参与外皮发生的基因十分活跃。本实验弥补了脊尾白虾EST方面研究的空白,为脊尾白虾作为虾类发育和免疫研究的动物模型进行应用奠定了重要基础。
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