【摘 要】
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本报告围绕"蛋白及其氧化修饰选择性识别DNA"的分子机制,揭示蛋白识别核酸底物的"选择性和特异性"的结构基础.首先应用化学交联技术探索碱基甲基化损伤修复蛋白与甲基化DNA的
【机 构】
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中国科学院上海药物研究所上海市祖冲之路555号,201203
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本报告围绕"蛋白及其氧化修饰选择性识别DNA"的分子机制,揭示蛋白识别核酸底物的"选择性和特异性"的结构基础.首先应用化学交联技术探索碱基甲基化损伤修复蛋白与甲基化DNA的相互作用,揭示去甲基化酶ALKBH2利用"手掌"构象主动探测双链DNA碱基对的稳定性,精准识别修复m1A甲基化的功能和分子机理,ALKBH3利用具有"拳头"构象的RED结构域特异性区分单双链DNA甲基化损伤;其次,病原菌转录因子蛋白通过半胱氨酸的不同类型(形成可逆的分子间的二硫键,过氧化等)的氧化修饰,实现对启动子DNA序列的分子识别,转录调控病原菌对氧化胁迫的感应与应答,例如表皮葡萄球菌AbfR和绿脓杆菌MexR.
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