【摘 要】
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为了研究牦牛α-酮戊二酸(盐)受体1(Oxoglutaratereceptorl,OXGR1)基因多态性与其体尺性状的相关性,本文以4-8岁天祝雄性(阉)白牦牛的血液DNA(n=192)为实验材料并构建DNA混合池.通过DNA直接测序法检测OXGR1的核苷酸序列潜在的多态位点;利用高分辨率熔解曲线分析技术(High Resolution Melting,HRM)进行分型.采用SHESIS软件对OX
【机 构】
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甘肃农业大学动物医学院,兰州730070 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070
【出 处】
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2017第四届中国肉牛选育改良与产业发展国际研讨会
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为了研究牦牛α-酮戊二酸(盐)受体1(Oxoglutaratereceptorl,OXGR1)基因多态性与其体尺性状的相关性,本文以4-8岁天祝雄性(阉)白牦牛的血液DNA(n=192)为实验材料并构建DNA混合池.通过DNA直接测序法检测OXGR1的核苷酸序列潜在的多态位点;利用高分辨率熔解曲线分析技术(High Resolution Melting,HRM)进行分型.采用SHESIS软件对OXGR1基因多态位点进行连锁不平衡分析;运用PIC-Calc0.6软件分析多态信息含量:采用卡方检验检测Hardy-Weinberg平衡;运用SPSS20.0软件对多态位点与体尺性状进行关联分析;运用RNAFOLD、ExPASy和Swiss-model软件对OXGR1基因突变前后的蛋白结构进行预测分析.结果表明:天祝白牦牛OXGR1基因发现有两个多态位点,分别为347(A/G)和678(G/A),每个位点均有3种基因型(AA、AG、和GG),其优势基因型分别为GG和AA.两个SNPs均达到Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05),存在强连锁不平衡(D＞0.75,R2＞0.33),且均表现为中度多态(0.25＜PIC＜0.5).上述位点不同基因型在体斜长、体高、胸围和管围存在显著差异(P＜0.05).分子结构预测显示:347位点处突变为错义突变,其编码的氨基酸由天冬酰胺变为丝氨酸.突变后OXGR1mRNA二级结构、蛋白质二级结构及三级结构均发生改变.上述结果表明:OXGR1基因可作为牦牛分子育种的候选分子标记,为今后牦牛遗传资源的保护、开发以及新品种的选育提供依据.
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