巨魾鱼线粒体12S rRNA和16S rRNA基因克隆及多态性分析

来源 :第四届中国西部动物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cubel
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  本文运用酚-氯仿方法提取12尾采集于云南省境内河口县的巨魾鱼的DNA,利用GenBank中的鮡科种类设计特异性引物进行PCR扩增和克隆,利用DNAMAN软件进行序列比对以及采用软件MEGA 4.0来分析巨魾鱼的碱基含量、遗传距离和系统进化树.结果显示:(1)得到954 bp的12S rRNA基因序列和1,712bp的16S rRNA基因序列各12条;(2) 12尾巨魾鱼的12S rRNA基因、16S rRNA基因以及12S rRNA基因和16S rRNA的合并基因序列的相似性分别为99.89%、99.95%及99.89%;(3) 12尾巨魾鱼的12S rRNA、16S rRNA、12S rRNA+16S rRNA均表现出A碱基含量偏高;(4) 12尾巨魾鱼的平均遗传距离为0.002,转换比颠换的平均值为3.065;(5)利用Neighbor-Joining(NJ)法构建的系统进化树表明魾属单独成一支,支持率达到99%,这一结果与传统的形态学分类基本相似.
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