【摘 要】
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目的 牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis)属杆菌门,是慢性牙周炎病变区及活动部位的主要优势菌.本研究旨在分析分离于慢性牙周炎患者口腔中的P.gingivalis菌株SJD2的基因组精细图特征.方法 提取P.gingivalis SJD2基因组DNA,并机械剪切获得496 bp片段,利用高通量测序获得测序覆盖率为100的短序列.经序列拼接组装,获得基因组精细图,并上传公
【机 构】
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上海交通大学医学院附属第九人民医院
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目的 牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis)属杆菌门,是慢性牙周炎病变区及活动部位的主要优势菌.本研究旨在分析分离于慢性牙周炎患者口腔中的P.gingivalis菌株SJD2的基因组精细图特征.方法 提取P.gingivalis SJD2基因组DNA,并机械剪切获得496 bp片段,利用高通量测序获得测序覆盖率为100的短序列.经序列拼接组装,获得基因组精细图,并上传公共数据库,进行编码序列预测,通过比对其特征性SD序列,获得最终的编码序列.下载已公布的P.gingivalis基因组序列,与SJD2基因组序列进行编码序列比对,分析SJD2基因组序列的特征基因.
其他文献
目的 探索一种新研制的抗菌肽Na1-P-113抑制和杀灭浮游状态和生物膜状态下P.gingivalisW83的有效性.方法 以洗必泰作为阳性对照,测定抗菌肽Na1-P-113对P.gingivalisW83的最小抑菌浓度,最小杀菌浓度,最小生物膜清除浓度,并绘制其对P.gingivalisW83的生长抑制曲线和时间杀灭曲线,采用扫描电镜观察Na1-P-113对浮游状态和生物膜状态下P.gingiv
目的 观察牙龈卟啉单胞菌脂多糖对小鼠骨髓基质细胞系ST-2细胞表达EphA4的调控作用,为研究EphA4在牙周炎发生发展中的作用奠定基础.方法 使用终浓度10μg/ml的Pg-LPS与ST-2共培养,分别在1、3和7d三个时间点,采用RT-PCR技术检测EphA4和Runx2基因的表达.
目的 通过研究伴放线聚集杆菌(Aggregatibacter actinomycetemcomitans,A.actinomycetemcomitans)的一种毒力因子细胞致死性膨胀毒素(cytolethal distending toxin,CDT)诱导人T淋巴细胞发生凋亡过程中的相关基因,探索其凋亡过程中可能存在的相关信号调节通路,寻找侵袭性牙周炎诊断及治疗潜在的生物标记分子.
目的 研究小鼠前成骨细胞系MC3T3-E1在成骨分化过程中,牙龈卟啉单胞菌脂多糖(Pg-LPS)对EphA2表达的调控作用.方法 使用终浓度1μg/ml的Pg-LPS与MC3T3-E1共培养,分别在3、7、14d三个时间点,采用RT-PCR和Western-Blot技术分别检测EphA2和成骨相关基因的表达及EphA2蛋白质的表达.
目的 已证实白介素-10(interleukin-10,IL-10)基因多态性影响IL-10的分泌.本研究旨在探索IL-10基因多态性与侵袭性牙周炎(aggressive periodontits,AgP)或慢性牙周炎(chronic periodontits,CP)的相关性及其对关键牙周致病菌伴放线聚集杆菌(A.actinomycetemcomitan,Aa)和牙龈卟啉单胞菌(P.gingiva
Objective Bacterial pathogens are frequently detected in atheromatous lesions, however, their contribution to atherosclerosis remains unknown.The present study was aimed to explore the effect of the P
目的 为了筛选口腔的高粘附性能益生乳杆菌,体外研究了四株乳杆菌——嗜酸乳杆菌(L.acidopilus JCM1132)、罗伊氏乳杆菌(L.reuteri CICC6119)、鼠李糖乳杆菌(L.rhamnosus CICC6141)和唾液乳杆菌(L.salivarius L3-7)对牙龈上皮细胞的粘附性能及机制.
目的 探讨牙龈卟啉单胞菌脂多糖(LPS)刺激淋巴细胞活化后效应T细胞的表达及意义.方法 选取10名全身及牙周组织健康受试者静脉血,分离外周血单核细胞(PBMC),体外刺激PBMC:实验组加入LPS冻干产物(浓度为1.0μ g/ml);阳性对照组加入刺激抗原PMA(25μ g/mL)+ionomycin(1 μ g/mL);阴性对照组不加任何刺激抗原.流式细胞仪检测T细胞内细胞因子IL-2、IFN-
目的 p21Cip1/Waf1/Sdi1 (p21)是目前已知的具有最广泛细胞周期蛋白依赖性激酶活性抑制的细胞周期素依赖性激酶抑制剂.本实验将进行体外研究牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,P.gingivalis)感染牙龈上皮细胞(HGEC)后p21的表达和对细胞周期的调控作用.
目的 通过牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,P.gingivalis)PG0839基因对小鼠肝细胞和血清中炎症因子白细胞介素1β(interleukin 1β,IL-1β)和白细胞介素6(interleukin 6,IL-6)的影响进行研究,以期为进一步明确毒力岛基因PG0839的功能提供实验依据.