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代谢工程(Metabolic Engineering)，亦称途径工程(Pathway Engineering)和代谢设计(Metabolic Design)，是一门利用分子生物学原理系统分析细胞代谢网络、并通过DNA重组技术合理设计细胞代谢途径及遗传修饰，进而完成细胞特笥改造的应用性学科。鉴于它涉及到多基因的联合协同表达控制机制，与传统的蛋白多肽单基因表面(第一代基因工程)以及基因定向突变(第二代基因工程)已有显著区别，故作者将之看作为第三代基因工程。该文列举部分代谢工程的应用实例，并对代谢工程的若干应用战略进行了概括性总结。