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目的：沙眼衣原体(Ct)感染是目前世界范围内流行最广的性传播疾病,除引起非淋球菌性尿道炎外,还可引起男性前列腺炎、女性盆腔炎、异位妊娠、不孕等严重并发症,是HIV感染的协同因子和重要危险因素,已构成严重的公共卫生问题.Ct的分型可很好地揭示Ct性网络传播模式、流行动态和致病性,也可分析变异株分布规律和趋势,对Ct的流行病学调查与控制具有重要意义.基于主要外膜蛋白(MOMP)和其编码基因omp1的分型方法,可将Ct分为15个血清型：A-K,L1-L3.但其在流行病学研究方面分辨率低、重复性差,不能满足Ct分子流行病学研究的需要.多重位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)被认为是一种新的可数字化定量统计的高分辨率的分型方法,可以反映菌株间基因水平微小变异,近年来逐渐被广泛应用于分子诊断和流行病学研究中.本研究旨在建立并评价ompI-MLVA双重分型方法,并应用此法对广州地区不同来源的Ct阳性株进行分型研究.方法：临床疑似Ct感染样本通过商品化核酸检测试剂盒进行检测,阳性标本纳入本研究进行ompI分型及MLVA亚分型.共纳入100例Ct阳性感染样本,包括男男同性恋(MSM)人群53例,临床性病门诊阳性病例47例.OmpI分型采用本实验室已经建立的巢式PCR,扩增Ct ompI,通过测序后与各型标准株序列比对判断型别.MLVA分型则结合Pedersen和Reinier的方法,通过改良设计针对串联重复次数差异性显著的3个可变数串联重复序列(VNTR)(VNTR-1291,VNTR1299,VNTR1335)的引物,优化PCR反应条件,进行PCR 扩增.以3个VNTR中任一靶序列出现不同重复序列定义MLVA 亚型.PCR扩增产物电泳后通过凝胶成像仪照胶和Bio-Numerics软件进行MLVA型别分析,通过公式计算分辨率(D：分辨率,N：总样本数,S：不同型别数,nj：各型别病例数).结果：成功建立了Ct的ompI-MLVA分型方法,ompI分型的分辨率为0.82,MLVA分型的分辨率为0.73,ompI-MLVA分型分辨率可达0.95.OmpI分型100例Ct感染人群,分型成功率为92％,以D型(30.4％)和G(23.9％)流行为主,均显著高于其他型别(p＜0.05),其次是J型(15.2％).其中53例MSM人群中,OmpI分型成功52例(98.1％),共检出5个血清型,以G型(38.5％)和D型(26.9％)流行为主,显著高于其他型别(p＜0.05),其次是J型(13.5％)；而47例性病门诊患者中,OmpI分型成功40例(85.1％),共检出9个血清型,以D型(35％)、F型(17.5％)和J型(17.5％)流行为主,D型流行显著高于其他型别(p＜0.05).MLVA分型100例Ct感染人群,分型成功率为97％,共检出31个亚型,以VNTR-1291,VNTR1299,VNTR1335单一重复序列流行为主(51.5％,50/97),显著高于其他型别(p＜0.01).OmpI-MLVA 双重分型将不同的ompI基因型再通过MLVA 将其亚分型,G、D、J型的MLVA 亚型类别最多,分别分为10、11、9个MLVA 亚型(见表1).不同人群中,Ct 流行特征有一定差异,MSM人群中,以D、G、J型和MLVA 单一重复流行为主,而在临床门诊Ct 阳性人群中,主要流行株则为D、F、J型和MLVA 单一重复型.MSM人群中的G型MLVA 单一重复型流行显著高于临床门诊Ct 阳性人群(p＜0.01),临床门诊Ct 阳性人群中F型MLVA 单一重复型流行显著高于MSM人群(p＜0.01).结论：OmpI-MLVA 双重分型是具有高分辨率的基因分型方法.应用该分型法可将各个OmpI基因型再次分为不同的亚型,在ompI分型流行率最高的D、G、J人群中,均以3个VNTR 单一重复序列组合流行为主.在同一ompI型别中,MLVA分型呈现分型多样性；在同一MLVA型别中,OmpI分型也呈现了多样性.不同人群中,OmpI-MLVA分型型别各不相同,呈现了不同分子流行病学特征.