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利用动物女儿设计群体，比较了混合模型最大似然连锁分析法（方法Ⅱ）与常规最大似然分析法（方法Ｉ）对ＱＴＬ检测和定位的效果，结果表明：①两种方法在ＱＴＬ定位和效应值估计方面具有相近的结果，ＱＴＬ定位的准确性主要依赖于ＱＴＬ遗传方差贡献大小；②两种方法的ＱＴＬ统计检测效率存在显著差异，方法Ⅱ考虑了随机多基因效应影响，使分析中误差方差降低，因而具有较高的检验统计量ＬＲ值，检测灵敏度和效率提高，犯Ⅱ型错误的概率显著降低。