RS/6000机群系统中分子动力学并行算法的研究

• 作 者: 吴江涛[1]刘志刚[1]何戈[2]董小社[2]
• 机 构: 西安交通大学能源与动力工程学院(西安)
• 出 处: 中国工程热物理学会工程热力学与能源利用学术会议
• 发表日期: 2001年期
• 关键词: 流体物性 分子动力学 机群系统 并行计算 原子分解法

通过对分子动力学并行算法的研究,本文在IBM RS/6000工作站机群和PVM环境中,消息传递机制方式实现了微正则系综(NVE)分子动力学的并行计算程序.通过对不同分子数(分子数从256～108000)组成的氩气系统模拟,认为在考虑分子间长程作用力时,采用原子分解法实现分子动力学并行算法具有理想的加速比,在只考虑分子间短程作用时,采用空间分解法算法则具有理想的加速比.