赤条蝽全线粒体基因组序列测定与分析

来源 :中国植物保护学会2016年年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ly_exe
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  蝽科是半翅目异翅亚目中较大的一个类群,其中很多种类是重要的农林牧业害虫.目前已有5种蝽科昆虫获得了线粒体基因组,但这些物种均来自蝽亚科.为了进一步深入了解蝽科昆虫的系统进化关系,本研究测定了来自蝽科另外一个亚科舌盾蝽亚科—一赤条蝽(Graphosoma rubrolineata)的全线粒体基因组.采用昆虫通用引物及新设计的特异引物扩增赤条蝽的全线粒体基因组,并进行双向测序.结果表明,赤条蝽全线粒体基因组是一个典型的闭合环状双链DNA分子,大小为15 633bp.与其他昆虫线粒体基因组一样,赤条蝽编码37个经典动物线粒体基因并包含一个控制区.基因排序与昆虫线粒体基因的原始排序完全一致.比较线粒体基因组学分析表明,赤条蝽线粒体基因组的大小、基因排序、碱基组成、密码子使用及转运RNA基因的二级结构等一般特征,在所有已测的6种蝽科昆虫中高度保守.赤条蝽线粒体基因组存在15个基因间隔区,其中最大间隔区位于trnS2和nad1之间,这一大的间隔区也普遍存在于其他蝽科昆虫中.此外,赤条蝽线粒体基因组还存在6个基因重叠区,其中最大的3个分别位于trnW/trnC(8 bp)、atp8/atp6(7 bp)和nad4/nad4L(7 bp),这与其余已测的5种蝽科昆虫高度相似.赤条蝽线粒体基因组的碱基组成明显偏向于A+T,赤条蝽J-链的A+T%为74.98%,介于斑须蝽(Dolycoris baccarum)的73.36%和稻绿蝽(Nezara viridula)的76.88%之间.赤条蝽13个蛋白质编码基因的A+T含量为74.31%,其中J-链和N-链的第一位点(66.86%,74.03%)和第二位点(65.66%,69.21%)的AT%含量明显低于第三位点(84.80%,88.68%).通常,昆虫线粒体基因组J-链的AT-偏斜为负值,而GC-偏斜为正值,如前面已测的所有蝽总科昆虫.然而,赤条蝽刚好相反,其J-链具有负的AT-偏斜(-0.068)和正的GC-偏斜(0.021).赤条蝽13个蛋白编码基因中,除cox1,atp8和nad1等3个基因的起始密码子为TTG之外,其余的起始密码子均为ATN.大多数蛋白质编码基因的终止密码子为TAA,而nad4的终止密码子为TAG,其余4个基因(cox1,cox2,had3和nad5)的终止密码子为T.基于13个蛋白质编码基因对赤条蝽及其他28种蝽次目昆虫进行了系统发育分析,最大似然法和贝叶斯推断获得的结果完全一致,均支持蝽次目的5个总科为单系群,且其系统发育关系为:(扁蝽总科+(蝽总科+(长蝽总科+(红蝽总科+缘蝽总科)))).尽管赤条蝽属于另一亚科,但在系统树中与横纹菜蝽、茶翅蝽和稻绿蝽等3种蝽亚科昆虫聚在一起,导致蝽亚科不是单系群.该线粒体基因组是首次测定的舌盾蝽亚科昆虫,为今后更好地理解蝽科昆虫的系统进化、开展物种界定及种群遗传学研究等提供基础数据.
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