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异蚤蝇属Megaselia是双翅目Diptera蚤蝇科Phoridae中最大的类群，体型较小，具典型性二型现象，超过60％为单性种类。在此基础上划分建立的属内阶元和分类系统存在较大争议，因此面临物种鉴定、雌雄配对与系统发育重建的难题。本研究针对传统分类学研究的难点，在其基础上应用DNA条形码技术解决了部分异蚤蝇属种类鉴定、雌雄配对难题，并对系统发育关系进行初步探讨。