【摘 要】
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本研究首次测定了核内重组激活RAG-1基因序列，分析了中国沿海9属13个种的石首鱼间的差异，旨在阐明石首鱼类的系统进化关系提供了分子依据，以期为中国石首鱼的种、属和亚科的
【机 构】
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中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业重点开放实验室,上海200090
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本研究首次测定了核内重组激活RAG-1基因序列，分析了中国沿海9属13个种的石首鱼间的差异，旨在阐明石首鱼类的系统进化关系提供了分子依据，以期为中国石首鱼的种、属和亚科的划分提供新的证据.用DNASTAR软件包和MEGA4.0软件进行所测序列和其他石首鱼类的同源片段序列的编辑、排序并去掉两端少许测序不稳定序列后进行比对.测得的51条RAG-1基因经序列比对后共有位点1498个，其中230个变异位点，共定义了39个单倍型.系统发育树以较高的置信度分为明显的两个类群：其中叫姑鱼亚科，石首鱼亚科，白姑鱼亚科和牙鱼或亚科聚为一大支；小黄鱼、棘头梅童鱼、大黄鱼和鮸鱼组成的黄鱼亚科形成一个单系群.根据所得分子生物学数据并结合已知形态学理论：1)银牙鱼或和红牙鱼或应归于一个属；2)叫姑鱼亚科和石首鱼亚科与其他石首鱼类存在明显差异，是石首鱼亚科中较早分化的种类；3)黄姑鱼较白姑鱼较为原始，白姑鱼亚科的分属问题有待进一步考证；4)同时从分子水平上再现了黄鱼亚科在石首鱼科系统发育中作为最新演化种类的进化地位.
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