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目的:探讨香菇杂交子及其亲本液体发酵基因差异表达与杂种优势的关系。方法:选用4个香菇菌株,组配3个杂交组合获得的17个杂交子,采用mRNA差异显示技术分析了杂交子和亲本之间液体发酵基因表达差异模式。结果:香菇杂交子与亲本之间基因表达差异模式可分为4种类型:双亲表达共沉默类型(W1)、单亲表达沉默类型(W2)、杂交子特异表达类型(W3)、单亲表达一致类型(W4),4种差异表达类型所占比例分别为5.30%、10.15%、7.88%、12.05%。差异表达模式与杂交子液体发酵菌丝生物量、胞内多糖含量、胞内多糖产量超亲优势相关分析表明双亲基因表达共沉默(W1)、杂交子基因特异表达(W3)与胞内多糖含量超亲优势呈极显著正相关,单亲基因表达一致(W4)、单亲基因表达沉默(W2)与胞内多糖含量超亲优势呈显著或极显著负相关,单亲基因表达一致(W4)与胞内多糖产量超亲优势呈显著负相关。结论:基因的差异表达与香菇杂种优势的形成可能有密切关系。