基于转录组测序数据分析香猪基因组可变剪接事件

来源 :第十一届西南三省一市生物化学与分子生物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户：glrioa

【摘要】

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可变剪接(alternative splicing)是基因最常见的转录调控方式之一,是真核生物控制基因表达,使转录组和蛋白质组产生多样性的重要机制.本文采用Illumina Hiseq2000测序平台对

【作者】

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唐靓婷冉雪琴王嘉福

【出处】

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第十一届西南三省一市生物化学与分子生物学学术研讨会

【发表日期】

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2016年7期

【关键词】

：

香猪基因组可变剪接事件转录组测序

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可变剪接(alternative splicing)是基因最常见的转录调控方式之一,是真核生物控制基因表达,使转录组和蛋白质组产生多样性的重要机制.本文采用Illumina Hiseq2000测序平台对高产和低产香猪共八个样本进行转录组测序,与Sus Scrofa10.2猪参考基因组进行比对.利用ASprofile从香猪基因组中共鉴定48755个可变剪接事件,影响19748个基因,占猪总基因数的78％.

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