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跨行政区创新网络是区域创新网络的难点领域。文章从网络科学基本理论出发，探讨了跨行政区创新网络的特点并构建了跨行政区创新网络发展模型。针对网络不同发展阶段的特点、发展方向和面临的瓶颈问题等，分析跨行政区创新网络建设的着力点和不同政策措施的组合与作用，为跨行政区创新网络建设提供理论依据。通过对京津冀创新网络建设进行案例分析发现，京津冀地区已经建立了积极的国际国内创新网络联系，但区内网络发展较慢，网络中心度较高，节点之间联系少，网络密度低、强度小，整体上处于有中心疏网的状态。在对制约京津冀创新网络发展的主要因素的分析的基础上，文章进一步提出了建设京津冀创新网络战略目标，并在此基础上提出了相应的政策建议。