一种高灵敏度的GII.17型诺如病毒基因组扩增方法

来源 :中国食品科学技术学会第十三届年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:memeshan
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  目的:本研究拟根据"4+1+1"扩增策略,建立一种快速、灵敏的GII.17型诺如病毒基因组扩增方法.方法与结果:首先根据GenBank中已有GIL.17型诺如病毒基因组序列的多重比对结果,理性设计了6对病毒基因组扩增引物,用于扩增获得可覆盖病毒基因组的6条重叠片段.同时,还设计了2奈洲序引物II.17-Seq1R和II.17-Seq6F,用于补充基因组的两端序列.通过采用终点稀释RT-PCR方法,证实了新设计引物均可达到常规检测引物G2SKF/G2SKR的灵敏度水平.最后,应用新建立方法在一个工作日内就成功获得了9奈广州地方的GII.17型诺如病毒毒株基因组.9条基因组全长均为7495bp,并通过系统发育分析对其基因型进行了验证.结论:根据一种新颖的"4+1+1"扩增策略,本文成功建立了一种快速、灵敏的GII.17型诺如病毒基因组扩增方法.意义:本文建立的新方法可作为GⅡ.17型诺如病毒基因组信息收集的重要工具,同时已获得的9株广州地区GII.17型诺如病毒基因组序列也将为病毒的进化研究提供重要参考数据.
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