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杜仲是我国特有的优质天然橡胶树种,也是名贵的中药材树种。本文全面总结了杜仲分子育种方面的最新研究进展。首先,通过杜仲叶片和果实的转录组测序及深度分析获得了大量基因的表达规律,如杜仲胶、α-亚麻酸、苯丙素类、黄酮类、类胡萝卜素等重要活性物质生物合成途径的相关基因的表达规律及关键酶基因信息,果实和叶片差异表达基因和特异表达基因的信息;发现了杜仲胶合成上游相关基因有124条,并分离克隆了28条杜仲胶合成上游途径MEP和MVA途径的重要基因cDNA全长,揭示其表达规律和序列特征,筛选其关键酶基因;杜仲胶合成下游相关基因共74条,其中分离克隆了35条如乳胶管蛋白(MLP)、橡胶延伸因子(REF)、橡胶小颗粒蛋白SRPP和杜仲胶合成关键酶基因异戊二烯磷酸二合酶(TIDS)的cDNA全长,并揭示其表达规律、遗传多样性、基因定位及功能差异;构建了杜仲胶合成基因的RNA干扰表达载体和过量表达载体,并对杜仲和烟草进行转基因试验,筛选出了杜仲胶合成上游和下游关键酶基因,初步分析表明,将提高杜仲胶含量18.65%~26.54%。为杜仲的分子育种打下了扎实的基础。开发了杜仲EST-SSR引物154条,筛选出了有效引物33对,并对258个不同地区、不同生境、不同类型杜仲种质资源进行遗传检测,首次揭示了杜仲遗传多样性、遗传变异、遗传分化、不同地区间的基因交流程度等,为杜仲种质资源的科学、有效利用提供了重要的依据。