基于转录组测序的菠菜SSR标记开发

来源 :中国园艺学会2014年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zfzhy

【摘要】

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菠菜是遗传研究和基因组信息比较缺乏的物种.菠菜基因组大小约为989 Mb,菠菜上可有效利用的标记数量非常有限,NCBI目前公布的EST-SSR序列只有225条,远不能满足开展菠菜遗传图

【作者】

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阎君于力许爽沈建华朱为民

【机构】

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上海市农业科学院园艺研究所,上海市设施园艺重点实验室,上海201403上海星辉蔬菜有限公司,上海201419

【出处】

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中国园艺学会2014年学术年会

【发表日期】

：

2014年10期

【关键词】

：

菠菜转录组 SSR

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菠菜是遗传研究和基因组信息比较缺乏的物种.菠菜基因组大小约为989 Mb,菠菜上可有效利用的标记数量非常有限,NCBI目前公布的EST-SSR序列只有225条,远不能满足开展菠菜遗传图谱构建的需要.基于新一代测序技术的高通量RNA-seq技术可以经济快速地得到大量转录组信息,并以此为基础大规模开发SSR标记.

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