【摘 要】
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长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200nt,但不能编码蛋白质的RNA.其表达或功能异常与肿瘤的发生发展关系密切.本研究主要探讨位于lncRNA 上的,尤
【机 构】
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华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病与卫生统计系430030
【出 处】
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2016遗传学与表观遗传学前沿暨第四届中国青年遗传学家论坛
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长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200nt,但不能编码蛋白质的RNA.其表达或功能异常与肿瘤的发生发展关系密切.本研究主要探讨位于lncRNA 上的,尤其是lncRNA：miRNA 结合区的基因遗传变异(single nucleotide polymorphisms,SNPs),是否可能通过改变lncRNA 和/或miRNA 功能来影响肿瘤易感性.我们首先采用生物信息学技术,充分整合目前已有的公共数据,预测可能落在lncRNA 与miRNA 结合位点的SNPs 及其对lncRNA 与miRNA 结合的影响,建立了lncRNASNP 数据库,可根据SNPs 的MAF、lncRNA 的保守性、miRNA 的表达量和是否与GWAS 相关等条件筛选潜在功能的SNPs.并对结直肠癌的GWAS 易感区域进行系统筛选和两阶段病例-对照研究.然后通过一系列功能实验,探索与肿瘤风险相关遗传变异的潜在生物学机制.
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