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黑木耳进入代料规模化栽培历史较短,产业规模发展速度却极快,已成为我国第二大食用菌。但是,黑木耳遗传育种基础研究薄弱,且无国际先进经验可借鉴,产业化技术研究缺乏坚实的理论支撑。因此,研究团队边开展前瞻性的遗传育种基础研究,边进行品种改良的相关产业化技术的集成创新。遗传连锁图谱是开展QTL定位和分子标记辅助育种的理论基础,在我国大宗栽培的食用菌中前六位,只有第二大食用菌黑木耳未构建连锁图谱。因此,本研究利用黑木耳栽培菌株"旗黑1号"的单核菌株A14-5、"旗黑2号"的单核菌株A18-119进行单单杂交,获得杂交菌株A119-5,从该杂交菌株获得138个单核菌株为作图群体。利用全基因组开发出能区分作图群体基因型的SSR引物,对A14-5、A18-119及作图群体进行SSR-PCR,通过Joinmap4.0软件对筛选的130个SSR标记进行连锁分析,构建11条连锁群,图谱总长854cM,标记间平均距离6.57cM。将作图群体与野生菌株A184的单核菌株A184-57测交,获得138个测交菌株作为定位群体,测定作图群体、定位群体在PDA培养基和木屑培养基上的菌丝生长速度,记录定位群体生育期、产量,利用复合区间作图法对菌丝生长速度、生育期和产量3个重要农艺性状进行QTL定位,共定位与菌丝生长速度有关的位点9个,分布在LG1、LG3、LG4和LG9;与生育期有关的位点2个,分布在LG2上;与产量有关位点3个,分布在LG2和LG6。研究结果表明生育期与产量存在连锁关系,菌丝生长速度与生育期、产量均不存在连锁关系,从性状遗传连锁分析上解决了菌丝生长速度和生育期是否具有相关性的争议,将菌丝生长速度作为熟期品种的筛选指标并不可靠。在已公开发表的SSR分子标记连锁图谱仅有双孢菇、姬松茸、双色蜡蘑、杏鲍菇,研究者为法国、韩国,本研究构建的黑木耳连锁图谱是我国第一张SSR遗传连锁图谱。黑木耳农艺性状QTL定位结果为开展黑木耳数量性状的基因定位、功能基因克隆和分子标记辅助育种等提供科学依据。本研究成果是已获得的全国创新争先奖、吉林省科技进步二等奖、长春市科技进步特等奖的重要成果组成。